Construtores de genoma?

Dezesseis anos atrás, o mundo conheceu o primeiro mamífero clonado: Dolly, a ovelha. Além do espanto ou medo que causou no momento, obtendo informações no biologia molecular Acelerou a um ritmo impressionante devido ao desenvolvimento de novas tecnologias, mais eficientes, mais rápidas e mais acessíveis.

Isso dá origem a uma desvantagem: como analisar e compreender todo esse mundo de dados e informações para detectar e resolver problemas biológicos? Na era do boom da construção do genoma, os pesquisadores combinam avanços em ciências genômicas e máquinas de computação para criar bancos de dados de informações biológicas em um livro eletrônico.

Especialistas em genômica computacional do Centro de Ciências Genômicas da UNAM guiar outros cientistas para as profundezas da natureza de um organismo. Sua missão é auxiliar pesquisadores nos estudos de genes e genomas, além de modelar e prever conceitos de biologia, como o comportamento de uma célula.

Uma das maiores conquistas da equipe, liderada pelo médico Julio Collado Vides , foi obter a sequência completa do genoma da bactéria Escherichia colli, contribuição publicada em 1997 na revista Ciência , um dos mais reconhecidos no mundo científico. Até o momento, o projeto central do grupo é a edição do livro eletrônico da fisiologia desta e de outras bactérias.

Genômica é o estudo da totalidade das propriedades do genoma: estrutura, interação e funções de seus componentes. O genoma é o material genético de um organismo e contém toda a informação necessária para a criação e desenvolvimento desse ser e a transferência de suas características de geração em geração.

O conhecimento derivado das ciências genômicas cresce dia a dia. Apenas cerca de 500 artigos científicos por ano são gerados em torno de Escherichia colli. "É o organismo mais conhecido a nível molecular. Daí nasceu a biologia molecular ", diz o cientista da universidade.

O grupo de genômica computacional revisa e preserva os dados capturados na literatura científica, os quais serão então interpretados por outros pesquisadores.

"Somos curadores, lemos artigos e extraímos evidências e descobertas, codificando toda essa informação em uma estrutura computacional que nos permite representar as partes da célula e suas interações", destaca Julio Collado.

Outros cientistas são responsáveis ​​por entender o significado desses dados e tirar conclusões, como explicar por que os humanos e as moscas são tão diferentes se o genoma coincide em 60%; ou porque vários membros de uma família desenvolvem certos tipos de câncer.

Diante desse panorama, Collado Vides se pergunta qual é o destino da bactéria Escherichia colli, como um subconjunto do conhecimento biológico que pode contribuir para a genômica do futuro. "Nós sabemos muito sobre um único organismo que o desafio é integrar todo o conhecimento que os cientistas geram para representar a complexidade biológica."

Com a infra-estrutura de primeiro nível do Grupo de Genômica Computacional, seus membros desenvolvem métodos de previsão de redes regulatórias, fatores de transcrição e associações funcionais entre genes.

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